El equipo inició el 2013 en la segunda división Liga de Nuevos Talentos con el nombre de Santos de Soledad , pero por una cuestión administrativa, la Federación Mexicana de Fútbol los registró como Atletico San Luis ya que en un principio el equipo se proyectaba como una filial. Logramos llegar a dos finales consecutivas en la LNT, en el Apertura 2013, perdiendo ante Pioneros de Cancun, y en el Clausura 2014, nuevamente quedaron subcampeones, esta vez ante Selva Cañera. Para el Apertura 2014, la franquicia de Bravos de Nuevo Laredo se mudo a Soledad, y formaron en tiempo y forma al nuevo Santos de Soledad, ahora en la segunda division Liga Premier, por lo cual la Federación los registró formalmente como Santos de Soledad.,

En el clausura 2016, el equipo comienza con una restructuracion importante, como primer movimiento se aununcia el cambio su sede como local al estadio Plan de San Luis de la capital potosina, ademas de que el equipo ahora sera llamado Santos San Luis F.C.